辐鳍鱼纲 (16144)
鲈形目
金眼鲷目
鲱形目
海鲂目
鲻形目
鲀形目
胡瓜鱼目
灯笼鱼目
鳕形目
鲽形目
蟾鱼目
鲉形目
巨口鱼目
裸背鱼目
银汉鱼目
背棘鱼目
狗鱼目
鲸口鱼目
喉盘鱼目
月鱼目
鼬鱼目
雀鳝目
海龙目
鼠鱚目
鲤形目
仙女鱼目
棘背鱼目
奇鲷目
辫鱼目
鳗鲡目
骨舌鱼目
鳉形目
鲟形目
海鲢目
鲑鲈目
鮟鱇目
囊鳃鳗目
北梭鱼目
鲑形目
弓鳍鱼目
脂鲤目
多鳍目
鲇形目
合鳃目
颌针鱼目
须鳂目
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日本银鮈
(Squalidus japonicus japonicus)
淡水 底中水层性. 温带
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日本银鑪
(Gerres japonicus)
海洋 居于水底的. 热带 砂泥底、河口、近海沿岸、泻湖 栖息于沿岸之沙泥底质之水域。肉食性，幼鱼时以浮游动物；成鱼时，掘食在沙泥地中躲藏的底栖生物。
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日本钝塘鳢
(Amblyeleotris japonica)
海洋 居于水底的. 亚热带的 近海沿岸、礁沙混合区 暖水性小型底层鱼类，生活于热带珊瑚礁的砾石中，与枪虾营共生生活。
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日本金线鱼
(Nemipterus japonicus)
海洋 居于水底的; 非迁移的; 深度上下限 5 - 80 m . 热带; 34°N - 11°S, 31°E - 133°E 砂泥底、近海沿岸 主要栖息于沿岸及近海砂泥底质的水域，栖息深度可达80公尺深。主要觅食甲壳类、头足类或其他小鱼等为食。
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日本辫鱼
(Ateleopus japonicus)
海洋 深海底的; 深度上下限 140 - 600 m . 温带 深海、砂泥底、近海沿岸 深海底层鱼类，栖息深度约在140-600公尺间砂泥底质的水域。生态习性尚未十分了解。
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日本裸平头鱼
(Xenodermichthys nodulosus)
海洋 底中水层性. 热带 深海、砂泥底、近海沿岸 主要栖息于中深层砂泥底海域，深度在100公尺到700公尺深的水层中，生态习性尚待研究。
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日本裸天竺鲷
(Gymnapogon japonicus)
海洋 底中水层性. 热带 礁区、近海沿岸 主要栖息于开放水域。以浮游动物或其它底栖无嵴椎动物为食。
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日本蝴蝶鱼
(Chaetodon nippon)
海洋 礁区鱼类; 深度上下限 5 - 30 m . 热带; 45°N - 5°N 礁区、近海沿岸 主要栖息于深度数十公尺以内的岩礁区，栖息水域较偏北方。春、秋之际，水温在摄氏23度左右，可于太阳下山后产卵。
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日本花鲈
(Lateolabrax japonicus)
海洋; 淡水; 半咸淡水 礁区鱼类; 降海洄游 ; 深度上下限 5 - ? m. 亚热带的; 44°N - 15°N, 106°E - 143°E 礁区、河口、淡水、近海沿岸 主要栖息于淡、海水交会区，且多半活动于具有流动水流之礁区。常上溯至淡水域觅食。每年春夏之际，幼鱼上溯，而在冬季时降游回大洋。性凶勐，以鱼、虾为食。
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日本舟尾鳕
(Kumba japonica)
海洋 深海区的; 深度上下限 550 - 710 m . 深水域 深海、砂泥底 主要栖息于550-710公尺深泥砂底质、水温5-7℃的水域。深海底栖性鱼类，以小型之多毛类、甲壳类及明虾为主食，数量不多。
