辐鳍鱼纲 (16144)
鲈形目
金眼鲷目
鲱形目
海鲂目
鲻形目
鲀形目
胡瓜鱼目
灯笼鱼目
鳕形目
鲽形目
蟾鱼目
鲉形目
巨口鱼目
裸背鱼目
银汉鱼目
背棘鱼目
狗鱼目
鲸口鱼目
喉盘鱼目
月鱼目
鼬鱼目
雀鳝目
海龙目
鼠鱚目
鲤形目
仙女鱼目
棘背鱼目
奇鲷目
辫鱼目
鳗鲡目
骨舌鱼目
鳉形目
鲟形目
海鲢目
鲑鲈目
鮟鱇目
囊鳃鳗目
北梭鱼目
鲑形目
弓鳍鱼目
脂鲤目
多鳍目
鲇形目
合鳃目
颌针鱼目
须鳂目
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日本小海鲂
(Zenion japonicum)
海洋 深海底的; 深度上下限 200 - 400 m . 深水域 深海 深海底层鱼类，栖息深度在200-400公尺间的大陆棚斜坡和陡坡，生态习性不详。
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日本小姥鱼
(Aspasma minima)
海洋 居于水底的. 亚热带的 礁区、近海沿岸 主要栖息于具褐藻的岩岸海域。癒合成吸盘状的腹鳍，使鱼体可以固着在岩石上而不被海波冲走。
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日本小口鲽
(Dexistes rikuzenius)
海洋 居于水底的; 深度上下限 42 - 200 m . 温带
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日本宽叉杜父鱼
(Furcina osimae)
海洋 礁区鱼类; 海洋洄游的 . 温带
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日本姬鱼
(Hime japonica)
海洋 居于水底的; 深度上下限 85 - 510 m . 热带 深海、砂泥底、近海沿岸 主要栖息于近岸砂泥底或岩石底之大陆棚区至大陆棚缘之深水域，为中小型底栖鱼类。栖息深度约在85-330公尺间。主要以鱼类及甲壳类为食。
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日本多囊狮子鱼
(Polypera simushirae)
海洋 居于水底的; 深度上下限 0 - 833 m . 温带
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日本园鳗
(Gorgasia japonica)
海洋 居于水底的; 非迁移的; 深度上下限 ? - 30 m . 温带 砂泥底 栖息于珊瑚礁沙质底海域，会利用尖且较硬的尾部钻沙，将身体埋在沙洞中，露出头部及一小部分身体随海流晃动，主要摄食小型浮游生物，通常为独居性群体生活。
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日本发光鲷
(Acropoma japonicum)
海洋 深海区的; 深度上下限 100 - 500 m . 深水域; 36°N - 37°S, 21°E - 154°W 深海、砂泥底、近海沿岸 主要栖息于大陆棚斜坡，深度约在100-500公尺间。肉食性，以甲壳类为主食。
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日本叉牙鱼
(Arctoscopus japonicus)
海洋 深海底的; 深度上下限 0 - 550 m . 深水域; 67°N - 32°N
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日本单鳍鱼
(Pempheris japonica)
海洋 底中水层性. 热带 礁区、近海沿岸、泻湖 主要栖息于清澈水质的泻湖及向海的珊湖礁盘下方或洞穴中，白天不易见其行踪，夜间则经常成一大群游动觅食。夜行性，以动物性浮游生物、小型底栖甲壳类或小鱼等为食。
